O principal objetivo do grupo de investigação Biomassa, Biorreatores e Bioprodutos para aplicações industriais (B. Factory) é contribuir para práticas sustentáveis, avanços tecnológicos e melhoria do bem-estar, integrando investigação em diversas áreas relacionadas com a biomassa, biorrefinarias, fontes proteicas, e nutrição. O grupo atua através de cinco linhas principais de investigação, cada uma abordando objetivos específicos. A primeira linha de investigação centra-se no processamento de biomassa e subprodutos da indústria alimentar para a obtenção de compostos de valor acrescentado com recurso a tecnologias verdes para o desenvolvimento de biorrefinarias. A segunda linha de investigação é dedicada a biorrefinarias baseadas em micro e macroalgas, abrangendo o design e caracterização de biorreatores para a produção de biomassa, proteínas e outras moléculas para aplicações alimentares e industriais. A terceira linha de investigação centra-se nos fundamentos e aplicações dos biorreatores, projetando especificamente novos reatores para a intensificação de processos. A quarta linha de investigação explora novas fontes de proteína para aplicações em alimentos mais saudáveis. A quinta linha de investigação, nutrição e bem-estar, dedica-se ao desenvolvimento de alimentos funcionais contendo ingredientes bioativos (prebióticos, probióticos, antioxidantes fitoquímicos e polifenóis).