O BIOSYSTEMS está focado no avanço do conhecimento e na transferência de tecnologia em Ciências da Vida, Processos Biotecnológicos, Químicos e Ambientais. O grupo usa a sua experiência em biologia de sistemas e bioengenharia para promover o avanço de uma bioeconomia baseada no conhecimento, resultando na inovação de novos produtos e processos com valor acrescentado. A linha de investigação em “Desenvolvimento e otimização de bioprocessos” tem como principal objetivo desenvolver e otimizar aplicações biotecnológicas de culturas microbianas, principalmente leveduras não convencionais, e fungos filamentosos. A linha de investigação em “Gestão Integrada de Bioprocessos” abrange a gestão integrada e análise de processos biológicos através de metodologias computacionais avançadas, visando otimizar o desempenho, aumentar a eficiência e facilitar uma compreensão abrangente da dinâmica de bioprocessos, incluindo o desenvolvimento de procedimentos de análise de imagens e ferramentas quimiométricas, e soluções de tecnologia analítica de processos para caracterização, monitorização e controlo de bioprocessos. A linha de investigação em “Biologia Sintética” utiliza ferramentas emergentes de biologia molecular e está focada no desenho racional, construção e otimização de novos organismos (bactérias, leveduras, fungos, células humanas) e sistemas biológicos para produzir bioprodutos de valor acrescentado para as indústrias química, alimentar, médica e agrícola.